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KAPA UDI接头 对接更出色的测序品质——KAPA独立双端标记接头

发表时间:2019-09-02 13:18

KAPA UDI接头 对接更出色的测序品质——KAPA独立双端标记接头

       KAPA独立双端标记接头的产生源于解决高通量测序进行多重混样时,容易发生不同样本的接头标签的错配问题。标签错配会增加测序结果中的噪音背景,尤其对低频突变的检测造成了极大的干扰,使结果可信度降低。错配的风险主要由以下原因引发:

  1. 测序仪工作时发生标签跳跃/转换现象(index hopping)

  2. 标签试剂或者样品间的交叉污染

  3. 混合样品在PCR扩增时发生的模板调换、测序反应错误以及数据分析错误等

通过改善接头序列的设计和质量控制可以极大地减少相关的错配现象的发生。

KAPA 新品上市

KAPA独立双端标记接头(Unique Dual-Indexed Adapters,UDI)经过严格QC验证,提供多达96种独特设计,有效减少标签错配,可满足各种高通量DNA和RNA测序应用的多重混样需求:

  • 高品质、即用型的全长双端标记接头,适配Illumina所有基于连接法文库构建的工作流程

  • 独特双端标签,罗氏独有设计,包含多达96种非重复组合的标签,减少标签错配带来的不利影响

  • 支持从低水平(≥2重)至高水平(多至96重)的多重混样测序,可用于各种型号的Illumina测序仪,且同时支持Patterned以及非Patterned测序芯片 (Flow Cell)

  • 可与KAPA HyperPrep、HyperPlus和所有KAPA RNA HyperPrep文库制备试剂盒联合使用,也可适配罗氏靶向捕获工作流程


    KAPA 产品特色

  • 严格的功能性验证(基于真实测序实验及数据分析的质控流程),有效阻断标签间的交叉污染

  • 优化的序列设计,提升文库构建效率,并显著减少接头二聚体;同时确保不同组合标签具有一致的文库转化率

  • 此96种接头标签序列为罗氏独特设计可单独应用,也可与客户现有标签序列联合应用,满足重数更多的混样需求

KAPA UDI接头的使用有效减少了进行多重混样测序时由标签错配导致的噪音背景,如图实验把污染率降低至0.2%以下。该数据集中的每个点均代表了使用PCR-Free建库流程获得的人全基因组样品的文库。在Illumina HiSeq X测序仪上对这些文库进行8重(黑点)或24重(蓝点)的混样测序,并通过VerifyBamID流程计算,反映出基于基因分型分析的潜在样品交叉污染风险。在这些污染中,观察到了标签跳跃的问题,且当使用KAPA UDI接头代替原先的单端接头时,这种非重复双端标记策略的实施显著减少了错配序列的污染率。图中绿线表征了污染率的平均值,红线表示统计学上限和下限(JMP分析)。数据由Broad Institute(Cambridge,MA,USA)提供。

KAPA接头试剂订购信息(请同时订购接头试剂及稀释缓冲液,如UDI+稀释缓冲液,或DI+稀释缓冲液)


* 仅供科研使用,不得用于诊断

Acadia No. MC-CN-00066 有效期至2021年8月28日



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