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STR/SSR 微卫星分析
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STR/SSR 微卫星分析
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微卫星标记(Microsatellite)也称为短串联重复序列(STR)或简单重复序列(SSR),是广泛分布在真核生物基因组中的简单重复序列。微卫星位点通常通过PCR扩增和电泳检测,并根据片段大小分离等位基因进行分析;扩增后的等位微卫星可以用ABI基因分析仪对荧光标记的DNA片段进行检测,结合分子量内标进行DNA片段长度计算。可以多重荧光引物复核扩增检测,具有检测通量高、速度快、分辨率高等优点,适合大量样本的检测。

华睿康科技优势:

1)高水准的技术团队:以多位分子学博士为支撑的技术团队;

2)高质量的产品支持:以优质试剂盒及相关产品为支持,极大地提高检测的灵敏度,且操作简单快捷;

3)检测通量高,可以多对不同片段大小,不同荧光标记的引物复合扩增,检测,提高检测通量,同时降低实验成本。

4)丰富的检测经验:拥有多年分子标记检测经验,为客户提供专业的技术服务;

5)全面的服务:华睿康科技为客户设置预实验,根据客户样品具体情况摸索最适的实验条件。

华睿康科技为您提供:

1)微卫星实验设计:包括扩增子选择和引物设计;

2)预实验:实验条件的优化和验证;

3)对基因组DNA进行PCR扩增;

4)对PCR扩增产物进行毛细管电泳;

5)片段大小的精确分析和等位基因读出。

微卫星后期数据分析:

(1) 遗传多样性分析

聚类分析;多样性分析;多态位点数(AP)、多态位点百分率(P)、平均等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)Nei′s基因多样性指数(H)Shannon′s信息指数(I)、遗传分化度(Gst)等。

(2) 遗传连锁图谱构建

利用F2、重组自交系(RIL)、CP群体、DH群体等通过检测的分子标记分型,由遗传重组测验结果推算出来的,标记之间的相对位置,从而构建出来的染色体遗传图谱。

微卫星.png(3) 关联分析

对检测到的分子标记的分型和表型性状结合,进行群体水平的统计学分析,

根据统计量或显著性p值筛选出最有可能影响该性状的遗传标记,挖掘出与性状变异相关的基因。


数据分析图

STR-鉴定图谱.jpg

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