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全基因组甲基化
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WGBS全面精准分析基因组甲基化:全基因组DNA甲基化测序(WGBS)是将重亚硫酸盐处理方法和Illumina高通量测序平台相结合,对有参考基因组的物种在全基因组水平进行高精准甲基化研究。WGBS可以达到单碱基分辨率,精确分析每一个胞嘧啶的甲基化状态,从而构建精细的全基因组DNA甲基化图谱。

生物体可遗传的表型除受DNA 序列的影响以外,还受DNA 甲基化修饰、组蛋白修饰、染色质空间排列等因素的影响。这些不依赖于改变DNA 序列而决定生物性状的遗传方式称之为表观遗传。全基因组重亚硫酸盐测序(Whole genome bisulfite sequencing, WGBS)是基于重亚硫酸盐的甲基化分析方法。首先通过重亚硫酸盐对样本DNA 进行处理,将未甲基化的C 碱基转化为U 碱基,而甲基化的C 碱基保持不变,再结合高通量测序技术,绘制单碱基分辨率的全基因组DNA 甲基化图谱。随着研究的深入,DNA 甲基化在生物发育与疾病发生过程中的调控机制日益清晰,调控网络日益完善,这也对甲基化的研究提出了更高的要求:全面、单碱基分辨率,结合多组学联合分析完善并细化调控网络等。

技术优势:

1、结果精准:精准到单碱基,可精准分析每一个C碱基的甲基化状态;

2、检测全面:可在全基因组水平上最大程度的获取完整的甲基化信息,精准绘制全基因组甲基化图谱;

3、适用性高:适用于所有有参考基因组的物种,性价比高。

研究趋势及热点:

表观修饰的变化广泛的存在于人和动植物内,甲基化的研究主要是研究表观遗传对表型变化的影响以机制:

1. 研究动植物的生长发育:如不同生长发育阶段,不同生长时期和不同组织等。

2. 研究动植物对环境胁迫的应答:如抗寒、抗旱、抗涝等。

3. 研究表观遗传机制。

4. 研究分化衰老机制。

5. 研究疾病发生发展机制:例如癌症导致的基因甲基化等。

全基因组甲基化测序.png


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