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KAPA HiFi高保真甲基化文库扩增试剂
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KAPA HiFi高保真甲基化文库扩增试剂
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产品介绍

甲基化研究时,亚硫酸盐处理将未被甲基化的C转变成U,导致基因片段中存在U。高保真酶因为有修复错配的功能,所以扩增过程中遇到U时会将其认作错误碱基进行切断,导致反应无法继续进行。KAPA HiFi Uracil+是在KAPA HiFi的基础上进行了改造,使其在PCR反应过程中遇到U不会终止反应,保证反应的正常进行。

1、主要应用

(1)二代测序中甲基化文库扩增; (2)其他甲基化研究。

2、技术优势

(1)可扩增含U的基因片段;(2)快速、高效; (3)产物Bias少;

(4)可扩增高AT/GC模板; (5)文库覆盖度高。

3、产品特点

(1)dUTP的存在对扩增无影响

  上图:实时荧光PCR扩增含Uracil体系,显示dUTP对KAPA Uracil+无抑制作用。用SYBR Green荧光定量PCR监测452bp基因的扩增情况,模板10倍梯度稀释(80pM-0.8fM),一组含有0.2mM的dUTP,另一组不含dUTP。扩增用的试剂分别为KAPA HiFi、KAPA HiFi Uracil+。结果显示KAPA HiFi在dUTP存在的情况下显著被抑制,而KAPA HiFi Uracil+则不受影响制。

(2)高效扩增经过亚硫酸盐处理的人类全基因组文库

  亚硫酸盐处理容易造成DNA损伤和降低DNA产物量。所以扩增时,因为抑制剂的存在、高A/T含量、DNA受损伤等因素叠加,导致了PCR产物量偏低、片段尺寸不合适、GC Bias等负面情况的发生。为了对比KAPA HiFi Uracil+与安捷伦的Pfu Turbo Cx,我们对比扩增亚硫酸盐处理之后的人类基因组文库,验证文库扩增产量和扩增Bias。

KAPA文库制备试剂盒制备片段长度为200-400bp的人类基因组文库,模板为5μg人类基因组DNA。亚硫酸盐处理之后,用KAPA文库定量试剂盒进行定量,发现约2.7%未转化基因组DNA残留。分别用KAPA HiFi Uracil+和安捷伦Pfu Turbo Cx扩增未稀释的亚硫酸盐处理后基因组DNA,然后再Bioanalyzer2100上进行分析扩增产物,结果如下图所示。


相关产品信息


产品型号规格价格
KAPA HiFi HS Uracil+RMKK2801、KK280250rxn、250rxn商议


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