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KAPA 核糖体去除链方向性RNA文库准备试剂盒
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KAPA 核糖体去除链方向性RNA文库准备试剂盒
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产品详情

产品介绍

1、产品应用

●高质量和低质量的RNA样本(例如从FFPE组织提取的)基因表达分析。

●单核苷酸变异(SNV)的发现。

●剪接位点和融合基因的识别。

●不带poly尾的RNA的特性分析,包括非编码RNA和前提RNA。

2、产品优势

●高达99.98% rRNA去除效率 ●起始总RNA范围为100ng~1μg

●适用物种为人、小鼠、大鼠 ●不同起始量均能得到可靠的、可重复结果

●工作流程易于实现自动化,已有多种自动平台的对接方案。

3、优势表现

1)行业领先的rRNA去除效果。能从FFPE样本中有效去除rRNA减少rRNA reads,测序更经济,转录本测序深度更深

2)最大的覆盖均一性

●各转录本读序(reads)分布均一

●5’-3’的偏好性小

3)无与伦比的测序数据质量

●检测更多基因和特定转录本

●准确、清晰地识别剪切位点和选择性剪切基因

●覆盖度高,能更好地检测困难或GC含量高的转录本

  采用KAPA Stranded RNA-Seq Kit with RiboErase工作流程所取得的高质量测序数据,同Illumina、NEB相似试剂盒的对比结果;

KAPA Stranded RNA-Seq Kit with RiboErase的工作流程不仅获得同类别试剂盒同等的测序读序映射率,同时重复率(duplication rates)低,覆盖均一性高,并且检测到更多数量的特异的转录片段和基因,从而使在样本中探测表达基因的灵敏度得到提高。

GC富集的转录片段的覆盖度提高:

  上图显示haemoglobin alpha transcript(HBA1)的测序覆盖度和剪切位点识别情况.HBA1的GC含量为62.8%.图中显示GC含量的轨道行将GC含量高的区域标注为红色.AT含量高的区域标注成蓝色,经过KAPA Stranded RNA-Seq Kit with RiboErase工作流程处理的样本(绿色),和与同类的Illumina试剂盒(橙色)或NEB试剂盒(蓝色)处理的样本相比,具有更均一的覆盖度,更灵敏的剪切位点识别,并且具有和未经rRNA处理样本(红色)相比更有代表性的数据图形样貌。

  低丰度转录片段的检测率提高:

MALAT1,一个低丰度非编码RNA片段,在文库制备过程中运用KAPA Stranded RNA-Seq Kit with RiboErase(绿色)其片段序列和剪切位点均能够被均一的覆盖,相比之下,使用Illumina-ZeroGold(橙色)和NEBNext(蓝色)的工作流程所得到的该转录片段的覆盖度的均一性较低。

4)可高度重复的测序结果

●即使测试条件不同仍热有很高的相关性

●样本间差异小,结果可靠

  重复样本之间基因表达水平的相关性:以上实验均使用100ng和UHR总RNA作为起始样本。使用KAPA Stranded RNA-Seq Kit with RiboErase的工作流程进行建库时,基因表达水品在重复样本之间显示出非常高的相关性(R2>0.973)高于使用Illumina或NEB同类试剂盒进行建库的情形。

相关产品信息

产品型号规格价格
KAPA Stranded RNA-Seq Kit with RiboErase HMRKK8483、KK848424rxn、86rxn商议



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